A seção é constituída de documentos produzidos pelos diversos setores, seções, diretorias, divisões e programas da FSESP tratando de assuntos referentes ás atividades finalísticas do órgão tais como ações de saúde e saneamento; formação e capacitação de profissionais de saúde; educação sanitária; assistência hospitalar em geral; enfermagem; pesquisas biomédicas; controle e combate á doença; engenharia sanitária; implantação de unidades sanitárias, hospitais, centros de saúde, laboratórios; construção e reformas de sistemas públicos de abastecimento de água e de esgotos sanitários; administração de autarquias municipais de água e esgotos; melhorias de habitações; higiene do trabalho; construção de residências; reparos e conservação de imóveis.

Reúne documentos diversos relativos à organização e ao funcionamento da Ensp, tanto no que diz respeito a aspectos técnico-acadêmicos quanto à administração geral.
No primeiro caso, destacam-se os materiais referentes à formulação, ao desenvolvimento e à avaliação de convênios, programas e projetos voltados às áreas de ensino, pesquisa e prestação de serviços em saúde pública, em muitos casos resultantes da cooperação com instituições brasileiras, estrangeiras e com organismos internacionais. Estes materiais contemplam , também, a realização de eventos acadêmicos-científicos ou de discussão de políticas públicas, incluindo a sua programação, os trabalhos apresentados e seus documentos finais. Dentre os registros que permitem um detalhamento das atividades finalísticas desenvolvidas, destacam-se textos, apostilas e outros materiais utilizados para fins didáticos ou como suporte à pesquisa, trabalhos, artigos e relatórios setoriais, assim como a correspondência emitida e recebida pela diretoria da unidade e pelos seus departamentos . Merecem destaque, ainda, os documentos que possibilitam a observação dos aspectos mais gerais do planejamento, da organização e do funcionamento da Fiocruz e da sua inserção em políticas públicas de âmbito nacional.
Quanto à documentação compreendida entre 1940 e 1954, esta refere-se à organização a ao funcionamento da Diretoria Nacional de Saúde.
A área de administração geral da unidade é contemplada, de forma abrangente, por documentos referentes a assuntos de pessoal, à aquisição e ao controle de materiais e equipamentos e, em menor escala, ao planejamento contábil da unidade.